Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms