Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB3O75112 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB3O75112 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LDB3O75112 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms