Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPLO60437 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPLO60437 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms