Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms