Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms