Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms