Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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