Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APEX2Q9UBZ4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms