Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHST12Q9NRB3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms