Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2TQ9NPD8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2TQ9NPD8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2TQ9NPD8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2TQ9NPD8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms