Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms