Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms