Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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