Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms