Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRXQ9BXM0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms