Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP88Q99567 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms