Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms