Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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TM4SF18Q96CE8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TM4SF18Q96CE8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TM4SF18Q96CE8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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