Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYRIPQ8NFW9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms