Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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