Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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