Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CLIP4Q8N3C7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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