Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIMS1Q86UR5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS1Q86UR5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms