Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms