Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDCA8Q53HL2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms