Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED5Q49AG3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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ZBED5Q49AG3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED5Q49AG3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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