Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms