Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FHOD3Q2V2M9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms