Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM187BQ17R55 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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FAM187BQ17R55 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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FAM187BQ17R55 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FAM187BQ17R55 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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