Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms