Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
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