Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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