Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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SS18Q15532 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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SS18Q15532 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SS18Q15532 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SS18Q15532 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SS18Q15532 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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SS18Q15532 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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