Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-323■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.357e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-207ENST00000469430 3767 ntTSL 212.65□□□□□ -0.397e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-209ENST00000483288 597 ntTSL 48.69□□□□□ -1.027e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.177e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.347e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-212ENST00000485178 474 ntTSL 54.06□□□□□ -1.767e-8■■■□□ 17.6
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PCBP2Q15366 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 17.6
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PCBP2Q15366 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GIT2-205ENST00000457474 5291 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.82e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITPA-210ENST00000609835 924 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 217.07■□□□□ 0.324e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITPA-204ENST00000460550 967 ntTSL 215.75■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 515.54■□□□□ 0.084e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITPA-208ENST00000483354 1028 ntTSL 315.45■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITPA-209ENST00000490838 977 ntTSL 214.94□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.223e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.133e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-204ENST00000438751 670 ntTSL 315.71■□□□□ 0.113e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-202ENST00000433764 569 ntTSL 415.47■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-208ENST00000456350 634 ntTSL 415.35■□□□□ 0.053e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-203ENST00000435366 1499 ntTSL 215.32■□□□□ 0.043e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-206ENST00000454184 547 ntTSL 415.17■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-210ENST00000566203 915 ntTSL 414.79□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-207ENST00000455178 395 ntTSL 514.3□□□□□ -0.123e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MMP24-AS1-212ENST00000635104 1227 ntTSL 511.24□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 515.25■□□□□ 0.033e-10■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-10■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.33e-10■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ATP6V0D1-217ENST00000568620 3390 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-10■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 EIF2AK2-202ENST00000390013 564 ntTSL 423.7■■□□□ 1.383e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 EIF2AK2-205ENST00000411537 623 ntTSL 514.09□□□□□ -0.153e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.773e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.663e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 BAX-209ENST00000506183 383 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.183e-11■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-11■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 BAX-204ENST00000356483 677 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.013e-11■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.053e-11■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.441e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 FCGRT-214ENST00000598927 1616 ntTSL 517.62■□□□□ 0.411e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 FCGRT-209ENST00000596147 383 ntTSL 316.74■□□□□ 0.271e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 FCGRT-207ENST00000595677 714 ntTSL 513.59□□□□□ -0.231e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-14■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.348e-9■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 REEP6-203ENST00000395484 611 ntTSL 511.18□□□□□ -0.628e-9■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 HNF1A-207ENST00000540108 3039 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ZYX-208ENST00000468083 1146 ntTSL 520.77■□□□□ 0.922e-12■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ZYX-209ENST00000477373 504 ntTSL 410.61□□□□□ -0.712e-12■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 520.02■□□□□ 0.81e-8■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-8■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 510.45□□□□□ -0.749e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 COASY-214ENST00000591779 994 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)14.03□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 314.19□□□□□ -0.147e-8■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.191e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.651e-6■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.259e-10■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.279e-10■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.329e-10■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 SPATA20-206ENST00000504265 877 ntTSL 219.36■□□□□ 0.691e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 SPATA20-221ENST00000512181 1456 ntTSL 219.05■□□□□ 0.641e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 SPATA20-213ENST00000505656 975 ntTSL 518.49■□□□□ 0.551e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 SPATA20-223ENST00000513618 629 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 SPATA20-225ENST00000515619 818 ntTSL 515.51■□□□□ 0.071e-7■■■□□ 17.5
PCBP2Q15366 SPATA20-228ENST00000635113 1706 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.071e-7■■■□□ 17.5
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