Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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IRF4Q15306 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IRF4Q15306 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IRF4Q15306 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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IRF4Q15306 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IRF4Q15306 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IRF4Q15306 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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