Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 562.3 ms