Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms