Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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