Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SSPNQ14714 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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