Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms