Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms