Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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