Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXF1Q12946 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF1Q12946 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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