Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMAN2Q12907 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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