Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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