Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms