Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms