Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms