Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCQ00610 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms