Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK3Q00526 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms